有机食品和绿色食品以及无公害食品这几类食品都是以无污染，安全、优质为特征的，但是达到此目的的方法与途径不尽相同，要求的严格程度也不同。

1.食品的生产、加工标准与其他无污染食品不同。

有机食品生产过程强调以生态学原理为基础，建立一个种养结合、循环再生的完整体系，尽量减少对外部物质的依赖，禁止使用一切人工合成的农用化学品；而其他无污染食品则强调减少农药化肥的使用与规范使用的方法、时间、次数来降低农用化学品的污染。

2.有机食品的检查认证与管理方法不同于其他无污染食品。

有机食品强调生产全过程的管理，其理论依据是有好的过程必定有好的结果；而绿色食品非常注重生产环境和产品的检测结果。有机食品认证主要是对生产方法、生产过程的认证，同时包括产品的加工处理。

3.认证管理方式有区别

像其他认证那样也对产品进行测试，但测试结果只能用来证明某种产品是不是按标准进行生产的。另外在认证管理上也有区别，有机食品要求每年都要接受至少一次检查认证，而绿色食品一次认证有效期为3年。

    因此，有机食品开发除与食品质量、人类健康相关外，还包含对环境保护、生态道德、社会公正等系列问题的考虑。